秘密商店位於靠近地圖中心的地方，一個秘密商店在上路和中路靠近 聖輝的森林裏，另一個在下路和中路靠近 魔魘的森林裏。能否購買與他們所在陣營無關，就連信使也可以使用。在秘密商店找到的物品不能在基地商店中購買。
秘密商店是由神秘商人打理的。
物品[]
基礎[]
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Function: CargoSQLQuery::run Query: SELECT `_pageName` AS `_pageName` FROM `cargo__items` WHERE available_at_secret_shop AND is_basic AND game IS NULL AND title NOT LIKE "河水藥瓶：%" GROUP BY `_pageID` ORDER BY `item_cost`,`title` LIMIT 100
升級[]
除了上述可以購買的物品之外，這些物品是完全可以在秘密商店中合成的：
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一些後期物品會有部分材料需要在秘密商店購買。
